在大健康产业布局上，娃哈哈实施生物工程、绿色提取、中医食疗、现代营养四大大健康布局。通过生物工程、现代提取等技术手段开展菌种、保健食品、天然产物、酶制剂等研究，经过科研人员不断探索研发，娃哈哈突破了国内在菌种采集、开发、生产等方面由国外垄断的局面，建设智能化菌种生产车间，成功打造目前国内一流的智能化菌种生产线。目前，娃哈哈已拥有超过4500株菌株的菌种资源库。