六月,壬戌日,宋王抵达建康。傅亮委婉暗示晋恭帝禅位给宋王,把写好的诏书草稿呈送给晋恭帝,让他亲笔书写禅位诏书。晋恭帝非常愉快地拿起笔,对左右亲信说:“桓玄之乱的时候,晋朝已经失去了天下,之后重新被刘裕扶植起来,这才延续了二十年的统治;今天的禅位给他,是我心甘情愿的。”于是在红纸上写下禅位诏书。
丁卯日,宋王在南郊设立祭坛,即位称帝。登基典礼完毕后,乘坐皇帝的车驾从石头城进入建康皇宫。徐广悲痛哭泣,侍中谢晦对他说:“徐公你这样犯的不是小错啊。”徐广说:“你是宋朝的佐命大臣,我是晋朝遗老,悲欢之情,自然是不同的。”
刘宋武帝刘裕登临太极殿,大赦天下,改换年号。宣布凡是行为不道德,受过舆论抨击的人,一律免除罪名,使其改过自新。
尊奉晋恭帝为零陵王,对他优待尊崇的礼节,都效仿晋朝初年优待魏室的旧例,又在故秣陵县为零陵王修建宫室,派冠军将军刘遵考率兵保卫。把晋恭帝的褚皇后降为王妃。
刘宋武帝追尊父亲为孝穆皇帝,追尊母亲赵氏为孝穆皇后,尊继母萧氏为皇太后,刘宋武帝侍奉皇太后十分恭谨,当他即位的时候,皇太后年岁已高,刘宋武帝每天清晨都要去给太后请安,从未错过时刻。