又在文学部中国哲学史室，见有光绪二十四年（1898年）大同译书局本《孔子改制考》，白纸正楷，与国内所见纸张不同。又见康有为《春秋董氏学》红本，康氏《中庸注》《论语注》都有，《大学注》终未找到。东大藏有《孔子改制考》初刻本和《春秋董氏学》红本，不知是否康氏或其弟子携来，上有印章“东京帝国大学图书馆印”。
又抄本中《论语义疏考订》，有吴骞序，注明由日本得之，也很珍贵。
另外光绪十四年（1888年）后邸抄、宫门抄也有收藏。
东京大学明治文库
东京大学明治文库藏书以报纸和文书最为可贵。
报纸有《沪报》光绪三十四年（1908年）十月一日至十一月二十八日；《循环日报》同治十三年（1874年）五月至六月二十七日，光绪六年（1880年）一月四日至九月，光绪十年（1884年）二月至八月，光绪十一年（1885年）一月至八月，十一月至十二月；《顺天时报》1913年7月18日至12月25日，1921年1月9日至1月14日，1922年1月30日至1926年12月31日；香港《华字日报》光绪二十二年（1896年）八月。《台湾日日新报》也藏该库，但不及守屋图书馆齐全。